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2D-DIGE, dias de présentation

URL: http://www.poirrier.be/~jean-etienne/presentations/2ddigecrc/index.php

Centre de Recherches du Cyclotron (ULg) - 24 octobre 2003

Cette présentation a été effectuée au tout début de notre utilisation du 2D-DiGE. Il y a donc quelques imprécisions (pas trop, trop grave, je pense). J'ai effectué une autre présentation sur le 2D-DiGE, plus complète, à la première rencontre du CJSFEAP, en janvier 2005 (version PDF 1.6 Mo).

Une bonne (autre) illustration de l'abondance de protéines chez l'être humain se trouve à la figure 1 de l'article de Kearney & Thibault "Bioinformatics meets proteomics - bridging the gap between mass spectrometry data analysis and cell biology" Journal of Bioinformatics and Computational Biology 1(1):183-200 (april 2003) (article in the sample given on their website ; doi:S021972000300023X).

• Alban et al., 2003. A novel experimental design for comparative two-dimensional gel analysis: two-dimensional difference gel electrophoresis incorporating a pooled internal standard. Proteomics, 3:36-44 (article par doi)
• Issaq et al., 2002. Methods for fractionation, separation and profiling of proteins and peptides. Electrophoresis, 23:3048-3061 (article par doi)
• Knowles et al., 2003. Multiplex proteomic analysis by two-dimensional differential in-gel electrophoresis. Proteomics, 3:1162-1171 (article par doi)
• Lilley et al., 2001. Two-dimensional gel electrophoresis: recent advances in sample preparation, detection and quantitation. Current Opinion in Chemical Biology, 6:46-50 (article par doi)
• Lopez et al., 2003. High-content proteomics: fluorescence multiplexing using an integrated, high-sensitivity, multi-wavelength charge-coupled device imaging system. Proteomics, 3:1109-1116 (article par doi)
• Merril et Washart, 1998. Protein detection methods. In Gel electrophoresis of proteins, ed. Hames, Oxford University Press, 1998: pp. 53-91
• Rabilloud et al., 2000. Ruthenium II tris (bathophenanthroline disulfonate), a powerful fluorescent stain for detection of proteins in gel with minimal interference in subsequent mass spectrometry analysis. Proteome, 2000 (online)
• Rabilloud et al., 2001. A comparison between Sypro Ruby and ruthenium II tris (bathophenanthroline disulfonate) as fluorescent stains for protein detection in gels. Proteomics, 1:699-704 (article par doi)
• Ünlü et al., 1997. Difference gel electrophoresis: a single gel method for detecting changes in protein extracts. Electrophoresis, 18:2071-2077